Este trabajo es quizás el mayor descubrimiento de esta especie de virus.
Por Fabián Pizarro
Los científicos han identificado más de 160.000 especies de virus de ácido ribonucleico (ARN), con la ayuda de la inteligencia artificial, en lo que es quizás el mayor descubrimiento de especies de virus.
La investigación fue realizada conjuntamente por científicos de la Universidad Sun Yatsen, Alibaba Cloud Intelligence, la Universidad de Sydney y algunas otras instituciones.
Los virus de ARN son omnipresentes, se encuentran incluso en los entornos más extremos y son los microorganismos más misteriosos, dijo Shi Mang, profesor de la Escuela de Medicina Zhongshan, de la Universidad Sun Yat-sen.
Desempeñan un papel fundamental en el ecosistema global y algunos de ellos son los patógenos detrás del brote de enfermedades infecciosas humanas, dijo.
Durante el curso de la investigación, se desarrolló un algoritmo de aprendizaje profundo denominado LucaProt para analizar los 10.487 datos de secuenciación de ARN generados a partir de muestras de diversos entornos, incluidos el aire, las fuentes termales y los respiraderos hidrotermales.
El algoritmo identificó 161.979 especies de virus ARN y 180 supergrupos de virus ARN, incluidos muchos grupos poco estudiados anteriormente, así como genomas de virus ARN de una longitud excepcional.
"La gran mayoría de estos virus ya habían sido secuenciados y estaban en bases de datos públicas, pero eran tan divergentes que nadie sabía qué eran", dijo Edwards Holmes, profesor de la Escuela de Ciencias Médicas de la Facultad de Medicina y Salud de la Universidad de Sydney.
"Estaban compuestos por lo que a menudo se denomina 'materia oscura' de secuencias. Nuestro método de IA pudo organizar y categorizar toda esta información dispar, arrojando luz sobre el significado de esta materia oscura por primera vez", se le citó en un comunicado publicado por la Universidad de Sydney.
La herramienta de IA fue entrenada para calcular la "materia oscura" e identificar virus basándose en secuencias y las estructuras secundarias de la proteína que todos los virus ARN utilizan para replicarse, acelerando el descubrimiento de virus que de otro modo llevaría mucho tiempo.
"Encontrar tantos virus nuevos de una sola vez es asombroso, y es apenas la punta del iceberg, abriendo un mundo de descubrimientos. Hay millones más por descubrir, y podemos aplicar este mismo enfoque para identificar bacterias y parásitos", dijo Holmes.
"El modelo de algoritmo de IA nos permite descubrir virus que antes eran desconocidos o que habían sido ignorados. Esta capacidad es especialmente importante para el control de enfermedades y la identificación rápida de nuevos patógenos", dijo Shi.
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